Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox10Q04888 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms