Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl7Q03366 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms