Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddr1Q03146 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ddr1Q03146 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddr1Q03146 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddr1Q03146 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms