Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb2Q00977 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms