Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F8a1Q00558 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
F8a1Q00558 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
F8a1Q00558 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
F8a1Q00558 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
F8a1Q00558 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
F8a1Q00558 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
F8a1Q00558 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
F8a1Q00558 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
F8a1Q00558 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
F8a1Q00558 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
F8a1Q00558 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
F8a1Q00558 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
F8a1Q00558 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
F8a1Q00558 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
F8a1Q00558 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
F8a1Q00558 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
F8a1Q00558 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms