Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
rp9P97762 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
rp9P97762 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
rp9P97762 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
rp9P97762 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
rp9P97762 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
rp9P97762 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
rp9P97762 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
rp9P97762 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
rp9P97762 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
rp9P97762 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
rp9P97762 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
rp9P97762 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
rp9P97762 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
rp9P97762 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
rp9P97762 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
rp9P97762 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
rp9P97762 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
rp9P97762 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
rp9P97762 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
rp9P97762 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
rp9P97762 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
rp9P97762 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
rp9P97762 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
rp9P97762 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
rp9P97762 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
rp9P97762 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
rp9P97762 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
rp9P97762 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
rp9P97762 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
rp9P97762 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
rp9P97762 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
rp9P97762 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
rp9P97762 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
rp9P97762 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
rp9P97762 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
rp9P97762 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
rp9P97762 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
rp9P97762 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
rp9P97762 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
rp9P97762 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
rp9P97762 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
rp9P97762 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
rp9P97762 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
rp9P97762 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
rp9P97762 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
rp9P97762 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
rp9P97762 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
rp9P97762 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
rp9P97762 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
rp9P97762 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
rp9P97762 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
rp9P97762 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
rp9P97762 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
rp9P97762 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
rp9P97762 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
rp9P97762 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
rp9P97762 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
rp9P97762 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
rp9P97762 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
rp9P97762 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
rp9P97762 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
rp9P97762 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
rp9P97762 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
rp9P97762 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
rp9P97762 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
rp9P97762 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
rp9P97762 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
rp9P97762 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
rp9P97762 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
rp9P97762 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
rp9P97762 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
rp9P97762 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
rp9P97762 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
rp9P97762 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
rp9P97762 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
rp9P97762 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
rp9P97762 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
rp9P97762 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
rp9P97762 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
rp9P97762 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
rp9P97762 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms