Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms