Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms