Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cux2P70298 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cux2P70298 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cux2P70298 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux2P70298 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux2P70298 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux2P70298 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux2P70298 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux2P70298 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux2P70298 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux2P70298 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux2P70298 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux2P70298 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux2P70298 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux2P70298 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms