Protein–RNA interactions for Protein: P70190

Capza3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza3P70190 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capza3P70190 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capza3P70190 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capza3P70190 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capza3P70190 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capza3P70190 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms