Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpfP62307 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpfP62307 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms