Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ufm1P61961 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ufm1P61961 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ufm1P61961 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ufm1P61961 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ufm1P61961 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ufm1P61961 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ufm1P61961 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ufm1P61961 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ufm1P61961 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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