Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp25P57080 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp25P57080 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp25P57080 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp25P57080 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp25P57080 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp25P57080 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp25P57080 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms