Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf5P56477 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Irf5P56477 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Irf5P56477 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irf5P56477 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Irf5P56477 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Irf5P56477 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irf5P56477 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irf5P56477 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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