Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2e3P52483 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2e3P52483 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2e3P52483 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2e3P52483 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2e3P52483 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2e3P52483 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2e3P52483 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2e3P52483 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2e3P52483 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2e3P52483 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2e3P52483 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2e3P52483 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2e3P52483 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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