Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms