Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpreP49446 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpreP49446 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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PtpreP49446 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpreP49446 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpreP49446 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PtpreP49446 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PtpreP49446 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PtpreP49446 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PtpreP49446 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PtpreP49446 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PtpreP49446 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PtpreP49446 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PtpreP49446 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PtpreP49446 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpreP49446 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms