Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbx1P41778 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms