Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms