Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afxP27661 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afxP27661 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afxP27661 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2afxP27661 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2afxP27661 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms