Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms