Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxb1P17919 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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