Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf1P15314 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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