Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc6P10629 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc6P10629 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc6P10629 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc6P10629 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc6P10629 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc6P10629 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc6P10629 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc6P10629 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms