Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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TtrP07309 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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TtrP07309 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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TtrP07309 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TtrP07309 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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TtrP07309 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TtrP07309 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TtrP07309 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TtrP07309 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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TtrP07309 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TtrP07309 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TtrP07309 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TtrP07309 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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TtrP07309 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TtrP07309 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TtrP07309 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TtrP07309 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TtrP07309 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TtrP07309 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TtrP07309 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TtrP07309 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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TtrP07309 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TtrP07309 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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TtrP07309 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TtrP07309 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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TtrP07309 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TtrP07309 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TtrP07309 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TtrP07309 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TtrP07309 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TtrP07309 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TtrP07309 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TtrP07309 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TtrP07309 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TtrP07309 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TtrP07309 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TtrP07309 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms