Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Ccl20O89093 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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