Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp4O70480 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms