Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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EllO08856 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EllO08856 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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EllO08856 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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EllO08856 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EllO08856 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EllO08856 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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