Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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