Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm2035J3QP87 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms