Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5294J3QP53 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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