Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Gm21818J3KMS6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Gm21818J3KMS6 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gm21818J3KMS6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gm21818J3KMS6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gm21818J3KMS6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gm21818J3KMS6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gm21818J3KMS6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gm21818J3KMS6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Gm21818J3KMS6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Gm21818J3KMS6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Gm21818J3KMS6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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