Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms