Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8247F6VRJ8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8247F6VRJ8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8247F6VRJ8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8247F6VRJ8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8247F6VRJ8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8247F6VRJ8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8247F6VRJ8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8247F6VRJ8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8247F6VRJ8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8247F6VRJ8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8247F6VRJ8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8247F6VRJ8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8247F6VRJ8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8247F6VRJ8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8247F6VRJ8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8247F6VRJ8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8247F6VRJ8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8247F6VRJ8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8247F6VRJ8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8247F6VRJ8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm8247F6VRJ8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm8247F6VRJ8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms