Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt78E9Q0F0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt78E9Q0F0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms