Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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Gm6880A3KG45 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Gm6880A3KG45 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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Gm6880A3KG45 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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