Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Top3bQ9Z321 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms