Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms