Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lgr5Q9Z1P4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms