Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ArcQ9WV31 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArcQ9WV31 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms