Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim44Q9QXA7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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