Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdc42ep4Q9JM96 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdc42ep4Q9JM96 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdc42ep4Q9JM96 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdc42ep4Q9JM96 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdc42ep4Q9JM96 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdc42ep4Q9JM96 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdc42ep4Q9JM96 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdc42ep4Q9JM96 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdc42ep4Q9JM96 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdc42ep4Q9JM96 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdc42ep4Q9JM96 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdc42ep4Q9JM96 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdc42ep4Q9JM96 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdc42ep4Q9JM96 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdc42ep4Q9JM96 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdc42ep4Q9JM96 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms