Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Tmod2Q9JKK7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Tmod2Q9JKK7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Tmod2Q9JKK7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Tmod2Q9JKK7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Tmod2Q9JKK7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Tmod2Q9JKK7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Tmod2Q9JKK7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod2Q9JKK7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms