Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clstn2Q9ER65 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms