Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms