Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C3

Alg13, Putative bifunctional UDP-N-acetylglucosamine transferase and deubiquitinase ALG13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg13Q9D8C3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Alg13Q9D8C3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alg13Q9D8C3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms