Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D7E4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms