Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms