Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18l2Q9D174 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ss18l2Q9D174 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms