Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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Exo5Q9CXP9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Exo5Q9CXP9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Exo5Q9CXP9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Exo5Q9CXP9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Exo5Q9CXP9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Exo5Q9CXP9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Exo5Q9CXP9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Exo5Q9CXP9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Exo5Q9CXP9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Exo5Q9CXP9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Exo5Q9CXP9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Exo5Q9CXP9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Exo5Q9CXP9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Exo5Q9CXP9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Exo5Q9CXP9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Exo5Q9CXP9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Exo5Q9CXP9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Exo5Q9CXP9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Exo5Q9CXP9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Exo5Q9CXP9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Exo5Q9CXP9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Exo5Q9CXP9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Exo5Q9CXP9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Exo5Q9CXP9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Exo5Q9CXP9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Exo5Q9CXP9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Exo5Q9CXP9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Exo5Q9CXP9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Exo5Q9CXP9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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